即便邻国埃塞俄比亚被视为咖啡的发源地，而肯尼亚的咖啡产业发展却相对较晚。最早关于咖啡进口的文献是1893年法国传教士自留尼汪岛带入咖啡树的记载；一般相信那是波旁种咖啡。收获第一批咖啡豆是在1896年。
最初咖啡是在英国殖民地统治下种植大型庄园中，收获的咖啡豆则运到伦敦销售。1933年咖啡法令通过，肯尼亚咖啡委员会成立，进而将咖啡销售事务转移回肯尼亚。1934年拍卖系统建立，至今仍在使用中。第二年，用以帮助改善咖啡质量的分级制度的草案正式拟定。
在20世纪50年代早期，肯尼亚茅茅起义（Mua Mua Uprising）发生不久后，政府通过一项农业法案，使每个家庭得以增加农地所有权，除了自给自足，也能种植经济农作物以便增加额外收入。此法案又名“Swynnerton Plan”，以农作部官员命名。
这也是咖啡生产由英国交接到肯尼亚的开始。小规模农耕所带来的效果显著，总收入自1955年的520万英镑提高到1964年的1400万英镑，其中55%的增长归功于咖啡生产。
肯尼亚在1963年独立，现今已能生产格式不同格式、品质极高的咖啡。肯尼亚在咖啡研究与发展上相当进步，许多农民都具备高度专业的生产知识。肯尼亚的咖啡竞标系统应该助于使那些重视质量的生产者获得更高的价格。不过，正是因为想买到优质咖啡的买家通常必须付出相对高价，拍卖系统内的贪腐状况反而使农民无法得到应有的回报。
分级
所有肯尼亚的外销咖啡不论是否具有产销履历，都使用相同的分级制度。正如其他许多国家，肯尼亚的分级也是以咖啡豆大小与质量作为指标，对咖啡豆大小有明确的规定，一定程度上也被视为质量优劣有直接关系。虽然这个理论基本上是正确的——例如AA级通常为顶级豆——但是AB级别的豆子也有可能高于许多其他的AA级豆。
E：即“象豆”，尺寸超大，产量相对较少。
AA：这是较为常见的等级，咖啡豆尺寸较大，颗粒大小高于18目（详情可见生豆精制处理Processing（下））或者7.22毫米。这类豆子通常可以获得更高的价格。
AB：此等级咖啡豆是将A（颗粒大小为16目或6.80毫米）与B（颗粒大小为15目或6.20毫米）合并；占肯尼亚咖啡年产量约30%。
PB：这是针对小圆豆的分级。这是指咖啡果中仅长出一个果核，而非普遍的两个果核。
C：此分级低于AB级，在高质量咖啡中少见。
TT：更低的等级，多半包含从AA、AB与E级豆中移除的小型豆。若以密度做筛选，最轻的豆子通常为TT等级。
MH/ML：这两个缩写代表的是Mbuni Heavy与Mbuni Light。Mbuni意思是经日晒处理的咖啡豆。这类豆子被认为质量较低，通常带有不成熟或过熟的咖啡豆，售价也相当低。此等级占肯尼亚咖啡年产量7%。
产销履历
肯尼亚咖啡由大型庄园或小农户们种植，小农户的咖啡会采收后送往当地的湿处理厂处理。这表示要得到可追溯性高的单一庄园最容易的，但是近几年来越来越多高质量咖啡来自小农户。通常这些来自特定湿处理厂的咖啡豆会标示颗粒大小等级（像是AA），不过同一批咖啡豆却可能来自上百个小农。这类湿处理厂在咖啡豆成品质量上扮演重要角色，因此这些咖啡也很值得细细寻求，肯尼亚的咖啡豆属于阿拉比卡种，咖啡因比较低，酸度适中，特别适合做冰咖啡，是世界上最好的咖啡之一，每年都大量出口到非常注重品质的德国、法国和日本。
咖啡口感
肯尼亚咖啡以鲜明而复杂的莓果和水果味著称（水果炸弹），同时带着甜美气息。特色是鲜明的水果香。尝试在咖啡中寻找这种风味，并留意它在口中的感觉。其中常见的水果香是柑橘。肯尼亚咖啡具有多层次感的口味和果汁的酸度，完美的柚子和葡萄酒的风味，醇度适中。
肯尼亚咖啡品种
肯尼亚有两个品种特别吸引精品咖啡从业者的注意：SL-28与SL-34。这是由斯科特实验室的盖伊·吉卜森领导的研究计划得出的40个试验品种之二。它们占肯尼亚高质量咖啡产量的绝大多数，不过这些品种容易得叶锈病。
肯尼亚在发展对叶锈病具抵抗力的品种上不遗余力。Ruiru11是第一个被肯尼亚咖啡委员会认可成功的品种，即便精品咖啡买家对此品种态度冷淡。近年来委员会推出另一个名为Batian的品种。有鉴于Ruiru11在杯测上令人失败的表现，众人对Batian的质量也有所怀疑。不过Batian的品质似乎有所改进，众人对其未来的杯测表现也持乐观的态度。
产区
NYERI
位于肯尼亚中部Nyeri是死火山肯尼亚的所在地。此区的红土孕育出肯尼亚最佳的咖啡。农业在此极端重要，咖啡则是其中最重要的农作物。由小农户组成的共同合作社比大型庄园普遍。此区有两次收成，但来自主产季的咖啡通常质量较高。
海拔：1200~2300米
采收期：10月~12月（主产季）、6月~8月（副产季）
品种：SL-28、SL-34、Ruiru11、Batian
MURANG’A
隶属中央省的此区约有10万咖啡农。这个内陆产区是首批传教士选择的定居之处，因为葡萄牙人禁止他们在海岸区居住，咖啡小农户数量多于庄园。
海拔：1350~1950米
采收期：10月~12月（主产季）、6月~8月（副产季）
品种：SL-28、SL-34、Ruiru11、Batian
KIRINYAGA
Nyeri产区东郊，此区也受益于火山土壤。咖啡通常是由小农户生产，湿处理厂也生产不少质量极高的咖啡，十分值得一试。
海拔：1300~1900米
采收期：10月~12月（主产季）、6月~8月（副产季）
品种：SL-28、SL-34、Ruiru11、Batian
EMBU
靠近肯尼亚的此区名称源自Embu城。当地约莫70%的人口从事小规模农耕，区内最受欢迎的经济农作物为茶和咖啡。几乎所有咖啡都来自小农户，此区产量相对较小。
海拔：1300~1900米
采收期：10月~12月（主产季）、6月~8月（副产季）
品种：SL-28、SL-34、Ruiru11、Batian、K7
MERU
此区咖啡多数由小农户种植在肯尼亚山麓以及Nyambene丘陵一带。名称指的是产区以及居住在此地的Meru人。20世纪30年代，他们是最早开始种植咖啡的肯尼亚人，这是因1923年所签署的白皮书，当中有保证在肯尼亚的非洲裔人士权益之重要性。
海拔：1300~1950米
采收期：10月~12月（主产季）、6月~8月（副产季）
品种：SL-28、SL-34、Ruiru11、Batian、K7
